Profesor:     Alicia Dickenstein

Puntaje:    4 puntos

Correlatividades: Geometría proyectiva y Cálculo avanzado

Carga horaria: 96 horas (6 horas por semana)

 Carreras:    
    Licenciatura en Matemática (Or. Pura y Aplicada)
    Profesorado en Matemática 

Breve descripción del curso:

1. Redes de reacciones con la ley de acción de masas -- Definiciones, ejemplos, espacio estequiométrico y quinético, propiedades principales.

2. Redes reversibles y débilmente reversibles. Puntos de equilibrio "complex balanced" y "detailed balanced".

3. Existencia de múltiples equilibrios (definición). Teoría de la deficiencia.

4. Redes de reacciones con estados estacionarios tóricos (definición y múltiples equilibrios).

5. Redes enzimáticas. Motivos.

6. Invariantes algebraicos en equilibrio, inferencia y reducción de los modelos.

7. Redes de reacciones sin la ley de acción de masas.

8. Redes de reacciones injectivas.

9. Oscilaciones y estabilidad en redes de reacciones.

10. Métodos gráficos para el estudio de redes de reacciones.

Bibliografía:

• Cox, D., Little, J., O’Shea, D., 1997. Ideals, Varieties and Algorithms, 2da. edición, Springer.
• Craciun, G., Dickenstein, A., Shiu, A., Sturmfels, B., 2009. Toric dynamical systems. J. Symb. Comput. 44, 1551–1565.
• Feinberg, M., 1979. Lectures on Chemical Reaction Networks. Lecture Notes. Mathematics Research Center, University of Wisconsin.
• Feliu E., Knudsen M., Andersen L.N., Wiuf C. (2012), An Algebraic Approach to Signaling Cascades with n Layers, Bulletin of Mathematical Biology, 74:1, 45–72.
• Gunawardena, J., 2003. Chemical Reaction Network Theory for In-Silico Biologists. Lecture Notes. Harvard University. Disponible en: vcp.med.harvard.edu/papers/crnt.pdf.
• Manrai, A., Gunawardena, J., 2008. The geometry of multisite phosphorylation. Biophys. J. 95, 5533–5543.
• Perez Millan, M., Dickenstein, A., Shiu, A., Conradi, C., 2012. Chemical reaction systems with toric steady states. Bull. Math. Biol. 74, 1027–1065.

Reunión preliminar:

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